Los afganos se caracterizan por ser una raza de perros bastante saludable, pero como todas las razas de perros tienen algunos problemas de salud específicos de los cuales sus propietarios deben estar enterados:

1. Enfermedades del Sistema Locomotor:
a) Displasia de la cadera.
b) Panosteitis: Inflamación de los huesos largos (húmero, radio, fémur y tibia).
c) En casos muy raros parálisis progresiva.

2. Enfermedades en los ojos:
a) Cataratas Juveniles: Opacidad de la lente o de la cápsula de la lente en el ojo.

3. Enfermedades de tipo Metabólico:
a) Problemas de la Gándula Tiroides: Al igual que el cáncer solo ciertas líneas de sangre la padecerán. Este problema metabólico de la glándula Tiroides (glándula encargada de producir las hormonas que regulan el metabolismo del cuerpo) generalmente afecta a perros viejos aunque puede presentarse a cualquier edad y se manifiesta como Hipertiroidismo cuando se producen muchas hormonas o como hipotiroidismo cuando la producción hormonal es poca. Esta última condición es la que más afecta a los perros y los signos clínicos serán caída de pelo especialmente a los lados del cuerpo, resequedad de la piel, ganancia de peso aunque el ejemplar no coma mucho y casi siempre estos perros tienen frío.

4.Otros :
a) Cancer:Tanto perros como humanos en cualquier momento podemos desarrollar un cáncer. En ciertas líneas de sangre hay predisposición y aunque esto no es muy común debemos estar pendientes especialmente en los cánceres que podemos ver o detectar con facilidad como en el de testículos en el caso de los machos y de la glándula mamaria en las hembras, otro tipò de afecciones solamente las podremos detectar y atacar a tiempo con visitas periódicas al veterinario.

Su promedio de vida es de 12 a 15 años.